O CIP 1 dispõe de microscopia óptica convencional e confocal para análise de materiais biológicos ou não.

Estereomicroscópio e lupas para avaliação de amostras em pequenos aumentos (até 40 x).

Microscópio Confocal de Varredura a Laser: Permite a avaliação de amostras por fluorescência ou reflexão. Possibilita o seccionamento óptico dos espécimes, eliminando a luz fora de foco, com maior resolução e contraste que a microscopia convencional. Aquisição de imagens 3D e sequências temporais.